A Nemzetközi Bűnügyi Együttműködési Központ, amely országos hatáskörű, területi jogállású szerv, – 2015. július 1-jétől – az alábbi szervezeti egységekre tagozódik:

• a Nemzetközi Bűnügyi Igazgatóság (NBI)
• Titkársági Osztály.

I. Nemzetközi Bűnügyi Igazgatóság (NBI)

Nemzetközi Stratégiai Osztály (Europol Nemzeti Iroda)

Az osztály feladatai a következők:

• stratégiai jellegű feladatok ellátása a Belügyminisztérium és külső szervek megkeresése alapján, valamint az Europol (Bűnüldözési Együttműködés Európai Uniós Ügynöksége), Interpol (Nemzetközi Rendőrség Bűnügyi Szervezete), SELEC (Délkelet-európai Rendészeti Központ), PCC SEE (Délkelet-európai Rendőri Együttműködési Egyezmény), illetve a bilaterális együttműködéssel összefüggésben (véleményezések, javaslattétel, vezetői döntés-előkészítés);
• az Europollal folytatott stratégiai jellegű együttműködés;
• az Europol mandátumkörébe eső nyílt és bűnüldözési operatív adatok továbbítása;
• kapcsolódó képviseleti feladatok ellátása (uniós intézmények és ügynökségek, valamint nemzetközi szervezetek fórumain);
• konferenciák, továbbképzések, tudatosságnövelő szemináriumok, kiutazások megszervezése és lebonyolítása;
• a rendőrség kihelyezett összekötőtisztjeinek kiválasztásával, kihelyezésével, külföldi tartózkodásával kapcsolatos feladatok ellátása;
• a nemzetközi vonatkozású, mandátumkörön kívül eső stratégiai megkeresések megválaszolása.

Europol Magyar Összekötő Iroda

A NEBEK „külső” szervezeti egységeként tevékenykedik az Europol hágai székházában működő Europol Magyar Összekötő Iroda, amely közvetlen nemzetközi kapcsolattartást végez a többi uniós tagállammal, valamint a harmadik országoknak, illetve nemzetközi szervezeteknek a székházban lévő összekötő irodájával. Munkájuk során folyamatos 24 órás elérhetőséget biztosítanak a hazai stratégiai és műveleti tevékenység támogatása érdekében.

NEBEK NBI Bűnügyi Együttműködési Főosztály

A konkrét bűnügyekkel kapcsolatos információátadást a Nemzetközi Bűnügyi Igazgatóság, Bűnügyi Együttműködési Főosztály alábbi három osztálya látja el:

Interpol Magyar Nemzeti Iroda

• nemzetközi bűnügyi információcserét folytat;
• nemzetközi szerződés, illetve kötelezettségvállalás alapján együttműködik a külföldi társszervekkel;
• nemzetközi vagy európai elfogatóparancs alapján nemzetközi körözést rendel el az Interpol Információs Rendszerben (IIS), illetve a Schengeni Információs Rendszerben (SIS II);
• közreműködik eltűnt személyek nemzetközi felkutatásában;
• részt vesz ismeretlen holttestek nemzetközi viszonylatú beazonosításában;
• megteszi a szükséges intézkedéseket bűncselekmény elkövetésével gyanúsítható személy nemzetközi viszonylatú tartózkodási helyének megállapítására;
• ellátja a kiadatás/átadás céljából őrizetbe vett személyek bíróság elé állításával és a tárgyaláson hozott döntéssel kapcsolatos értesítési, tájékoztatási és szervezési feladatokat;
• koordinálja és részt vesz a kiadatások, átadások, elítélt személyek átszállításának végrehajtásában; 
• intézkedik nemzetközi viszonylatban körözött tárgyak, okmányok felkutatására;
• részt vesz a 2008/615/IB tanácsi határozat alapján végzett, DNS és ujjnyom adatcserét érintő másodlagos prümi információcserében;
• együttműködik az Europol Magyar Összekötő Irodával;
• sürgős esetben nemzetközi bűnügyi jogsegélykérelmet továbbít.

SIRENE Iroda

• nemzetközi bűnügyi információcserét folytat;
• nemzetközi vagy európai elfogatóparancs alapján nemzetközi körözést rendel el az Interpol Információs Rendszerben (IIS), illetve a Schengeni Információs Rendszerben (SIS II);
• közreműködik eltűnt személyek nemzetközi felkutatásában;
• részt vesz ismeretlen holttestek nemzetközi viszonylatú beazonosításában;
• megteszi a szükséges intézkedéseket bűncselekmény elkövetésével gyanúsítható személy nemzetközi viszonylatú tartózkodási helyének megállapítására;
• ellátja a kiadatás/átadás céljából őrizetbe vett személyek bíróság elé állításával és a tárgyaláson hozott döntéssel kapcsolatos értesítési, tájékoztatási és szervezési feladatokat;
• koordinálja és részt vesz a kiadatások, átadások, elítélt személyek átszállítása végrehajtásában; 
• intézkedik nemzetközi viszonylatban körözött tárgyak, okmányok felkutatására;
• biztosítja a SIS II-ben szereplő figyelmeztető jelzésekkel kapcsolatos kiegészítő információ cseréjét;
• részt vesz a schengeni rendőri együttműködési feladatok kapcsán jelentkező koordinációs, képzési, jogalkotási és képviseleti tevékenységben;
• koordinálja a magyar hatóságok által elhelyezett figyelmeztető jelzések minőségének ellenőrzését;
• megteszi a szükséges intézkedéseket a schengeni információs rendszerben tárolt figyelmeztető jelzésekhez kapcsolódóan beérkezett bejelentések és panaszok ügyében;
• részt vesz a 2008/615/IB tanácsi határozat alapján végzett, DNS és ujjnyom adatcserét érintő másodlagos prümi információcserében;
• információt cserél az Europol Magyar Összekötő Irodával.

Nemzetközi Információs Osztály

• folyamatos (24/72) elérhetőséget  biztosít a hazai szervek részére a nemzetközi bűnügyi együttműködés vonatkozásában;
• nemzetközi bűnügyi információcserét folytat;
• nemzetközi szerződés, illetve kötelezettségvállalás alapján együttműködik a külföldi társszervekkel;
• biztosítja a schengeni információs rendszerben szereplő figyelmeztető jelzésekkel kapcsolatos kiegészítő információk cseréjét;
• koordinálja a hazai Közös Szolgálati Helyek nemzetközi információcsere keretein belül kifejtett tevékenységét;
• ellátja a nemzetközi kötelezettségvállalásban vagy hazai jogszabályban előírt kontaktponti feladatokat;
• részt vesz a 2008/615/IB tanácsi határozat alapján végzett, DNS és ujjnyom adatcserét érintő másodlagos prümi információcserében;
• információt cserél az Europol Magyar Összekötő Irodával.

NEBEK NBI Körözési Nyilvántartó és Szakirányító Főosztály

A Kormány 2015. július 1-jétől a körözési nyilvántartási rendszerről és a személyek, dolgok felkutatásáról és azonosításáról szóló törvény szerinti nyilvántartó szervként a Nemzetközi Bűnügyi Együttműködési Központot (a továbbiakban: NEBEK) jelölte ki. A NEBEK Nemzetközi Bűnügyi Igazgatóságon belül, a Körözési Nyilvántartó és Szakirányító Főosztály (a továbbiakban: KNYSZF) két osztály – az Adatkezelő és Alkalmazás-felügyeleti Osztály, valamint a Szakirányító és Koordinációs Osztály – útján végzi a körözési nyilvántartó szerv hatáskörébe tartozó alábbi főbb feladatokat:

• biztosítja a körözési nyilvántartási rendszerben kezelt és nyilvántartott adatok tekintetében az adat- és titokvédelmi szabályok érvényre jutását;
• vezeti a nyilvántartás használatára jogosultak nyilvántartását;
• az adattovábbítás jogszerűségének ellenőrzése, valamint az érintett tájékoztatása céljából kezeli az adattovábbítási nyilvántartást;
• végzi a rendőr-főkapitányságok, rendőrkapitányságok és határrendészeti kirendeltségek körözési eljárásának szakirányításával összefüggő feladatokat;
• ellátja a körözés elrendelésében és a körözési eljárásban érintett rendőri és nem rendőri szervek személyi állományának képzésével, továbbképzésével kapcsolatban a hatáskörébe utalt feladatokat;
• a körözési nyilvántartási rendszer üzemzavara esetén országos illetékességgel az NS.CP Portálon jelzéskezelési műveletet végez;
• a körözési nyilvántartási rendszerbe bejegyzett adatok közhitelességének biztosítása érdekében együttműködik a körözés elrendelésére jogosult szervekkel, a feltárt adathibák megszüntetésére – az érintett szerv útján vagy saját hatáskörben – intézkedik a nyilvántartás adatainak javítására;
• folyamatosan együttműködik a körözés elrendelésére jogosult nem rendőri szervekkel;
• a körözési adatkezelési feladatok szakszerű ellátása céljából a rendőri és nem rendőri szervek részére igazgatási támogatást biztosít.

II. NEBEK Titkársági Osztály

A Titkársági Osztály hivatali, ügykezelési, humánigazgatási, képzési, adatvédelmi, minősített adatvédelmi, ellenőrzési és fegyelmi feladatköröket lát el, továbbá biztosítja az ügyintézés jog- és szakszerűségét, az igazgatói döntések végrehajtásának megszervezését, összehangolását.